流域に限らず地球や地域をひとつのシステムとして捉えるとき、実験室内で細胞をシステムとしてとらえて研究するときとの決定的な相違は、地球、地域はひとつしかなく、複製を作ることができず、たとえ実験区を設けて複製を疑似的に作成したとしても、実験条件を制御しきることは不可能であるという点にある。